AZF локус, как выбрать нужный анализ?

Аллели, локусы и маркеры: что это?

В современной генетической науке широко используются термины – аллели, локусы, маркеры. Между тем, от понимания таких узких терминов часто зависит судьба ребенка, ведь диагностика отцовства напрямую связана с этими понятиями.

Генетическая особенность человека

Любой человек имеет собственный уникальный набор генов, получаемый им от родителей. В результате комбинации совокупности родительских генов и получается совершенно новый, уникальный организм ребенка со своим набором генов.

В генетической науке современными исследователями для проведения диагностики были выявлены определенные участки генов человека, имеющие наибольшую изменчивость – локусы (второе их название маркеры ДНК).

Любой их данных локусов имеет множество генетических вариаций — аллелей (аллельных вариантов), состав которых сугубо уникален и сугубо индивидуален для каждого человека. К примеру, у локуса цвет волос есть два возможных аллеля – темный или светлый.

Каждый маркер имеет свое индивидуальное количество аллелей. Одни маркеры содержат 7-8, другие более 20. Комбинация аллелей у всех исследованных локусов называется ДНК профилем определенного человека.

Именно вариативность данных участков генов и дает возможность проводить генетическую экспертизу родства между людьми, ведь ребенок от своих родителей получает по одному из локусов от каждого родителя.

Принцип генной экспертизы

Генетическая процедура по установлению биологического отцовства помогает установить, является ли тот мужчина, который считает себя родителем определенного ребёнка, настоящим папой или данный факт исключен.

Для экспертизы биологического отцовства при проведении анализа происходит сравнение локусов между родителями и их ребенком.Современные методики анализа ДНК способны одновременно проводить исследование генома человека сразу же по нескольким локусам.

Например, в стандартизированное генное исследование включена экспертиза сразу 16 маркеров. Но сегодня в современных лабораториях экспертные исследования делают почти по 40 локусам.

Проведение анализов осуществляют с использованием современных генных анализаторов – секвенаторов. На выходе исследователь получает электрофореграмму, на которой указаны локусы и аллели анализируемой пробы. Таким образом, в результате проведения анализа ДНК анализируют присутствие определенных аллелей в анализируемой пробе ДНК.

Определение вероятности родства

Для определения уровня родства профили ДНК, которые были получены для определенного участника экспертизы, проходят статистическую обработку, по результатам которой эксперт делает вывод о процентной вероятности родственной связи.

Для того, чтобы рассчитать уровня родства, определенная статистическая программа производит сравнение по наличию одинаковых аллельных вариантов всех исследованных локусов из проанализированных. Расчет проводится между всеми участвующими в анализе.

Результатом расчета становится определение комбинированного индекса отцовства. Вторым показателем служит вероятность отцовства. Высокое значение каждой из определяемых величин является доказательством биологического отцовства обследуемого мужчины.

Как правило, для расчета показателей родства используют базу данных аллельных частот, полученных для населения России.

Положительный результат сравнения 16 различных, случайно выбранных маркеров ДНК позволяет, согласно данным статистики, определить вероятность отцовства. Однако при несовпадении результатов по аллелям из 3 или большего количества маркеров из 16, результат экспертизы биологического отцовства считается отрицательным.

Точность результатов экспертизы

На точность результатов генной экспертизы влияют несколько факторов:количество анализируемых генетических локусов;природа локуса.

Генетический анализ как можно большего количества локусов, уникальных для определённого человека, позволяет более точно установить (или наоборот, опровергнуть) степень вероятности отцовства.

Таким образом, достигаемая степень вероятности при одновременном анализе до 40 различных локусов составляет до 99.9% для подтверждения вероятности биологического отцовства, а также до 100% при получении отрицательного результата.

Определение биологического отцовства со степенью вероятности 100% невозможно в связи с теоретической возможностью существования мужчины с таким же набором маркеров ДНК, как у отца ребенка. Однако при уровне вероятности 99,9 % проведенную экспертизу считают положительной, а отцовство – доказанным.

Какие источники ДНК подходят для анализа?

ДНК экспертиза является высокочувствительной процедурой, не требующей больших количеств образца для извлечения ДНК.

Благодаря современным научным достижениям генную экспертизу для определения вероятности отцовства можно проводить, используя как биологический материал, полученный от определённого человека (мазок изо рта, волос, кровь), так и материал небиологический, то есть лишь только соприкосающийся с человеком (например, его зубная щетка, предмет одежды, детская соска, кухонная посуда).

Это возможно благодаря тому, что во всех человеческих клетках, вне зависимости от их происхождения, молекулы ДНК совершенно одинаковы, что дает возможность сравнения образцов ДНК полученных изо рта пациента с образцом из крови, или из пробы ДНК, полученной от зубной щётки или одежды.

Новые достижения в определении отцовства

Новым словом в определении отцовства стала разработка микрочиповой диагностики. Благодаря указанию на микрочипе (небольшой пластинке) почти всех генов человека определение отцовства не составит сложности.

Такая технология похожа на генетический «паспорт». Взяв у плода пробу крови или амниотической жидкости, можно будет легко выделить из нее ДНК и провести гибридизацию на микрочипы родителей.

Исследователи планируют использование данной технологии также для определения наследственных заболеваний.

Источник: https://testdnk.pro/informacia/alleli-lokusy-i-markery-chto-eto.html

Мужское бесплодие. Генетическая диагностика азооспермии. Исследование микроделеций в AZF локусе Y хромосомы

array(19) { [«catalog_code»]=> string(6) «180037» [«name»]=> string(197) «Мужское бесплодие. Генетическая диагностика азооспермии. Исследование микроделеций в AZF локусе Y хромосомы» [«period»]=> string(1) «5» [«period_max»]=> string(2) «12» [«period_unit_name»]=> string(6) «к.д.

» [«cito_period»]=> NULL [«cito_period_max»]=> NULL [«cito_period_unit_name»]=> NULL [«group_id»]=> string(6) «392581» [«id»]=> string(4) «3675» [«url»]=> string(119) «muzhskoje-besplodije-geneticheskaja-diagnostika-azoospermii-issledovanije-mikrodelecij-v-azf-lokuse-y-khromosomy-180037» [«podgotoa»]=> string(136) «

Не менее 3 часов после последнего приема пищи. Можно пить воду без газа.

» [«opisanie»]=> string(12974) «

Метод исследования: ПЦР с детекцией в режиме «реального времени».

Диагноз бесплодия у семейной пары ставится при условии отсутствия зачатия в течение 1 года регулярной половой жизни без контрацепции.

Около 25 семейных пар из 100 не достигают беременности в течение 1 года, среди них 15 супружеских пар лечатся по поводу бесплодия, а около 5 семейных пар так и остаются бесплодными.

Примерно 40% случаев приходится на мужское бесплодие, 40%— на женское, ещё 20% — на смешанное.

Среди основных причин мужского бесплодия выделяют:

• врожденные или приобретенные аномалии мочеполовых органов (например, дефекты строения семенников, перекручивание яичек, травмы полового органа);
• воспаление, инфекции мочеполовой системы (прежде всего, ИППП);
• повышение температуры в мошонке (например, вследствие варикозного расширения вен яичка);
• гормональные нарушения (например, дефицит тестостерона);
• нарушения иммунной системы (например, антиспермальные антитела в эякуляте);
• генетические нарушения.

Генетические факторы обуславливают, по крайней мере, 30—50% всех случаев тяжелых форм бесплодия у мужчин.

Среди генетических причин мужского беслодия выделяют:

1. хромосомные аномалии (например, синдром Клайнфельтера)
2. микроделеции (небольшие потери участка) Y-хромосомы, захватывающие регион, названный «фактор азооспермии» (AZF).
3. и другие (более редкие)

Делеции AZF-локуса связаны с различной степенью нарушения образования сперматозоидов от умеренного снижения до практически полного отсутствия половых клеток в семенных канальцах – синдром клеток Сертоли (СКС).

При нарушении сперматогенеза (согласно определению ВОЗ) различают: олигоспермию (концентрация сперматозоидов < 20 млн/мл), азооспермию (отсутствие сперматозоидов в эякуляте), когда концентрация сперматозоидов не превышает 5 млн/мл говорят об олигоспермии тяжелой степени.

Микроделеции локуса (участка) Y хромосомы обнаруживаются в 10-15 % случаев при азооспермии и в 5–10 % случаев при олигозооспермии тяжелой степени. Выявление микроделеций AZF-локуса позволяет оценить вероятность обнаружения сперматозоидов при биопсии яичка, что необходимо для выбора правильной тактики лечения.

В определенных случаях, возможно преодоление бесплодия с помощью вспомогательных репродуктивных технологий, а в других (более редких) случаях, выполнение экстракорпоральных методов оплодотворения будет иметь неблагоприятный прогноз.

Кроме того, выявление микроделеций AZF-локуса позволяет оценить, есть ли риск, при успешной попытке зачатия, рождения у пациента сыновей с подобным диагнозом.

Молекулярно-генетический анализ микроделеций Y-хромосомы позволяет установить причину бесплодия и имеет большое значение при целесообразности применения методов по преодолению бесплодия.

Внимание! Перед проведениям данного анализа рекомендовано исследование: Спермограмма (код услуги 110401). Данные спермограммы необходимы для заполнения анкеты в направительном бланке.

Показания к исследованию:

• В комплексе диагностических методов при обследовании бесплодной пары;
• При планировании вспомогательных репродуктивных технологий в рамках комплексного клинико-генетического обследования;
• Для решения вопроса о выборе адекватных способов преодоления бесплодия;
• Азооспермия/ олигозооспермия тяжелой степени (< 5 млн сперматозоидов/мл эякулята);
• Для оценки вероятности выделения сперматозоидов для вспомогательных репродуктивных технологий (ЭКО/ИКСИ);
• Для оценки риска нарушений фертильности у сыновей мужчин с выявленными делециями AZF.

Интерпретация результатов:

Для каждой мутации (делеции), если делеция не обнаружена, в бланке ответа в графе «Результат» вносят «Не обнаружено», в случае детекции делеции – «Обнаружено». В графе «Референсные значения» напротив этого параметра стоит значение «Не обнаружено».

Пример результата исследования. Мужское бесплодие. Генетическая диагностика азооспермии.

Параметр Результат Референсные значения

Делеция в локусе AZFa (фактор азооспермии), sY86	ОБНАРУЖЕНО	Не обнаружено
Делеция в локусе AZFa (фактор азооспермии), sY84	ОБНАРУЖЕНО	Не обнаружено
Делеция в локусе AZFa (фактор азооспермии), sY615	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ (фактор азооспермии), sY127	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ (фактор азооспермии), sY134	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ (фактор азооспермии), sY142	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ (фактор азооспермии), sY1197	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ, AZFс (фактор азооспермии), sY254	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ, AZFс (фактор азооспермии), sY255	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ, AZFс (фактор азооспермии), sY1291	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ, AZFс (фактор азооспермии), sY1125	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZ, AZFс (фактор азооспермии), sY1206	Не обнаружено	Не обнаружено
Делеция в локусе AZFс (фактор азооспермии), sY242	Не обнаружено	Не обнаружено

Источник: https://www.cmd-online.ru/analizy-i-tseny/muzhskoje-besplodije-geneticheskaja-diagnostika-azoospermii-issledovanije-mikrodelecij-v-azf-lokuse-y-khromosomy-180037/